农作物论文_白花刺续断野生居群的叶绿体全基因

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文章摘要:白花刺续断是藏区一种常用的药用植物，但其叶绿体全基因组的研究较少。为揭示该物种叶绿体全基因组的基本特征并探讨其谱系遗传结构，该研究利用Illumina测序平台对来自5个野生居群的10个白花刺续断个体进行二代测序，经组装、注释，得到10条完整的叶绿体全基因组序列，并对它们的基因组特征和居群间的谱系进化关系进行了初步研究。研究结果表明：（1）白花刺续断的叶绿体全基因组大小为155 335～156 266 bp，共注释113个基因，包括72个蛋白编码基因、30个t RNA基因和4个r RNA基因，其叶绿体基因组的大小、结构、GC含量及基因组成等方面在种内高度保守；（2）基因组比较分析表明，白花刺续断变异较大的片段均位于单拷贝区，且IR边界未出现明显的扩张和收缩；（3）群体遗传分析发现，白花刺续断的野生居群具有明显的地理遗传结构，不同居群间在遗传距离与地理距离上具有一定的相关性。该研究表明，白花刺续断叶绿体基因组在种内居群水平上比较保守，且叶绿体基因组可在居群水平上揭示物种的地理遗传结构。这为后续开展刺续断属物种群体遗传学和系统发育基因组学研究奠定了基础。

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项目基金:《基因组学与应用生物学》网址: http://www.jyzxyyyswx.cn/qikandaodu/2022/0106/624.html